Урологическая клиника, открытая в 1866 году, на медицинском факультете Московского университета, внесла большой вклад в развитие отечественной урологии. Подобно больнице Неккер в Париже, где зародилась французская урологическая школа Гюйона, наша клиника является колыбелью русской урологии. Ее первым директором был И.П. Матюшенков.  

После него клиникой заведовали И.А.Бредихин, Ф.Е. Гааг и В.А. Басов. С 1878 года до 1907 г. клиникой руководил профессор Ф.И. Синицин.

При нем большое внимание уделялось «малой урологии», болезням мочеиспускательного канала, совершенствованию техники камнесечения мочевого пузыря и камнедробления.

Впервые была установлена эндокринная связь между предстательной железой и яичками, позволившая в дальнейшем выдвинуть теорию эндокринного генеза опухолей простаты, на основании которой в настоящее время проводится гормональная терапия рака простаты.

С 1907 по 1917 гг. клиникой последовательно руководили А.В. Мартынов, Ф.А. Рейн, И.П. Алексинский, И.Х. Дзирне.

В 1923 году клинику возглавил проф. Р.М. Фронштейн. С этого момента стали широко развиваться хирургия органов мочеполовой системы. Основные проблемы этого периода: почечнокаменная болезнь, туберкулез, новообразования, аденома простаты.

 Большое внимание уделялось патогенетической терапии гонореи, подготовке кадров для организованной широкой сети отделений и диспансеров.

Р.М. Фронштейн был одним из основателей журнала «Урология», председателем Московского общества урологов, его учебник по урологии выдержал 3 издания и долгое время был настольной книгой урологов. В соавторстве с С.П. Федоровым им написано руководство по оперативной урологии.

 Под руководством Р.М. Фронштейна защищено 23 докторских и кандидатских диссертаций, вышло около 500 научных работ. Он был избран действительным членом АМН СССР. Для увековечивания памяти Р.М. Фронштейна в 1949 году урологической клинике I ММИ присвоено его имя.

В 1949 году клинику возглавил ученик Р.М. Фронштейна – И.М. Эпштейн. Без малого почти 20 лет под его руководством были разработаны и внедрены многочисленные методы рентгеновского обследования, позволяющие расширить диапозон диагностических возможностей.

Особенно много сделано в разработке и усовершенствовании рентгендиагностики почечнокаменной болезни, туберкулеза мочеполовой системы, опухолей почки, мочевого пузыря, простаты, аномалий и травматических повреждений мочеполовых органов.

 Впервые в Советском Союзе при клинике производится радиоизотопное скенирование почек неогидрином, меченным ртутью 203 и 193, позволяющее получить изображение почек, определить их форму, размеры, положение, количество и качество функционирующей паренхимы.

Впервые в нашей стране в клинике применен ультразвуковой щуп, позволяющий во время операции определить местоположение камня.

 В 1961 году совместно с клиникой факультетской хирургии организована лаборатория «искусственная почка», оснащенная 5 аппаратами отечественного производства.

Из стен клиники вышло 23 монографических работы, более 600 статей, защищено 5 докторских и 24 кандидатских диссертаций. В 1959 году издан учебник «Урология», в котором отражены все изменения во взглядах по различным вопросам урологии и новейшие достижения науки со времени выхода в свет учебника Р.М. Фронштейна. В 1968 году учебник И.М. Эпштейна вышел вторым изданием.

В 1969 году клинику возглавил заслуженный деятель науки РСФСР, член-корр. АМН СССР, профессор Ю.А. Пытель.

Наиболее значительными проблемами, над которыми работала клиника, было раскрытие патогенеза пиелонефрита, механизма литолиза уратных конкрементов и биохимизма действия литолитических средств, разработка торакоабдоминальных и торакальных доступов к почке, техника расширенных и органосохраняющих операций при раке почки, обоснована необходимость и техника резекции почки при коралловидном нефролитиазе.

 Большое внимание уделялось разработке и внедрению новых оперативных пособий с учетом анатомо – функциональных и физиологических особенностей почек и мочевых путей. Крупное народнохозяйственное значение имело внедрение в урологическую практику аутогемотрансфузии.

Почти полный отказ от донорской крови и использование аутологической не только позволило избежать осложнений гемотрансфузий, что предельно важно при заболеваниях почек, но и получить весьма значительный экономический эффект.

За разработку и внедрение в практику метода аутогемотрансфузии в 1986 году Ю.А. Пытелю и ряду сотрудников клиники была присуждена Премия Совета Министров СССР. За период с 1969 года по 1998 год Ю.А. Пытелем и его учениками опубликовано более 700 научных работ, в том числе 2 учебника по физиологии мочевых путей, 5 монографий по основным проблемам урологии и оперативной нефрологии, сделано открытие и 43 изобретения, подготовлено и защищено 13 докторских и 52 кандидатских диссертаций.

В 1976 году урологическая клиника переехала в новое здание, увеличилось число коек до 100. Впервые создан учебный отдел, включающий профилированные учебные классы, укомплектованные наглядными пособиями, тренажерами, электрофицированными самопроверочными стендами. В обучении студентов стало использоваться учебное телевидение, накоплен банк учебных видеофильмов.

Широко внедрены в педагогический процесс все элементы единой методической системы, определены цели курса, которые координированы с другими кафедрами. Результатом этой работы явилось издание интегрированной программы по урологии, методических разработок к практическим занятиям по урологии со студентами, методических разработок для преподавателей.